Profil Epidémiologique Moléculaire de l’Infection à VIH de Type 1 chez les patients naïfs de traitement à Kinshasa
Kamangu EN1,2, Bulanda BI², Bongenia BI², Botomwito HT², Mvumbi GL1, De Mol P3, Dolores Vaira4, Marie-Pierre Hayette3, Kalala RL1.
1 Service de Biologie Moléculaire, Département des Sciences de Base, Faculté de Médecine, Université de Kinshasa, RDC
2 Groupe de Recherche «Focus VIH/SIDA», Kinshasa-RDC
3 Laboratoire de Microbiologie Clinique, CHU-Lg, Liège, Belgique
4 Laboratoire de Référence SIDA, CHU-Lg), Liège, Belgique
Historique de l’article : Reçu le 2 mai 2015 ; Accepté le 8 février 2016
Profil Epidémiologique Moléculaire de l’Infection à VIH de Type 1 chez les patients naïfs de traitement à Kinshasa
Molecular Epidemiologic Profile of HIV type 1 Infection in treatment-naïve patients in Kinshasa
Background & Objective: In the Democratic Republic of Congo (DRC), the subtype A of HIV-1 is predominant but its molecular profile is little documented. This work aims to describe the molecular epidemiologic profile of HIV infection in treatment-naïve patients in the city of Kinshasa.
Methods: In a cross-cutting approach, 153 subjects HIV Type 1 positive (60% women) and naïve to treatment recruited in 8 centers of Kinshasa, were selected between August 1, 2013 and February 28, 2014. The Reverse Transcriptase PCR and a Nested PCR were used for the amplification of regions of interest on the Protease and Reverse Transcriptase for subsequent sequencing. The amplified fragments were sequenced by the Sanger method. The matching of the fragments obtained was performed with the software Vector NTI Advance® 11.5 and compared with different databases.
Results: The mean age of the study subjects was 37 years. Protease and Reverse Transcriptase were amplified and sequenced respectively, for 130 (84.9%) and 145 (94.8%) patients. The subtype A was predominant with 35 cases (22.9%); followed by CRF02_AG (11.1%), C (9.8%), G (9.8%), K (9.8%), D (7.8%), H (7.8%) and J (5.0%).
Conclusion: This work demonstrates a strong diversity and heterogeneity of HIV Type 1 in the city of Kinshasa.
Keywords: Molecular epidemiology, Sequencing, HIV, Kinshasa
Contexte & objectif : En République Démocratique du Congo (RDC), le sous-type A du VIH-1 est prédominant mais le profil moléculaire reste peu documenté. Ce travail a pour objectif de décrire le profil épidémiologique moléculaire de l’infection à VIH chez les patients naïfs de traitement dans la ville de Kinshasa.
Méthodes : Par une approche transversale, 153 sujets VIH Type 1 (60% de femmes) et naïf de traitement recrutés dans 8 centres de Kinshasa, ont été retenus, entre les 1er Août 2013 au 28 Février 2014. Une Reverse Transcriptase PCR et une PCR Nichée ont servi pour l’amplification des régions d’intérêt sur la Protéase et la Transcriptase Reverse pour un séquençage ultérieur. Les fragments amplifiés ont été séquencés par la méthode de Sanger. L’appariement des fragments obtenus a été effectué avec le logiciel Vector NTI Advance® 11.5 et comparé avec différentes bases de données.
Résultats : L’âge moyen était de 37 ans. La Protéase et la Reverse Transcriptase ont été amplifiées et séquencées respectivement, pour 130 (84,9%) et 145 (94,8%) patients. Le sous-type A était prédominant avec 35 cas (22,9%) ; suivi par CRF02_AG (11,1%), C (9,8%), G (9,8%), K (9,8%), D (7,8%), H (7,8%) et J (5,0%).
Conclusion : Ce travail démontre une forte diversité et hétérogénie du VIH Type 1 dans la ville de Kinshasa.
Mots clés : Epidémiologie moléculaire, Séquençage, VIH, Kinshasa.
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