Molecular characterization of African swine fever Virus isolates involved in infection persistence in Central Africa: Democratic Republic of Congo Caractéristiques moléculaires du virus de la peste porcine africaine en Afrique centrale : cas de la R

Contexte : La Peste Porcine Africaine (PPA) est un réel frein à l’allègement de la pauvreté et à la sécurité alimentaire des populations les plus démunies en milieu rural africain. Le porc domestique y représente, non seulement une source d’épargne ambulante pour les frais médicaux, scolaires et diverses taxes, mais aussi une source précieuse de protéine animale. Cette affection est endémique en Afrique Sub-saharienne, notamment en République Démocratique du Congo.
Objectif : Genotyper, à travers une étude retrospective, une des souches les plus devastatrices, et établir des liens phylogéographiques pour une meilleure compréhension de l’épidémiologie en vue d’une stratégie de contrôle  adaptée.
Matériel et méthodes : prélèvements (sang et organes) sur les porcs domestiques des sites les plus touchés, évaluation de la prévalence apparente, détection de l’ADN viral et caractérisation respectivement par les tests d’ELISA indirect, PCR et Séquencage appuyés par la culture cellulaire et l’immunohistochimie.
Résultats : Les Anticorps Anti –VPPA ont été détéctés chez 73 porcs sur 350 (20.8%), l’ADN du virus a été détécté dans les echantillons provenant de 5 fermes, la séquence du gène d’immunodominance d’une souche impliquée dans le foyer le plus sévère a été décryptée et, la comparaison de ces dernières avec les isolats d’autres zones géographiques a permis d’établir une similarité génétique .
Conclusion: Les souches identifiées en RDC montrent une homologie avec celles isolées en Afrique de l’ouest.
Mots clé: Virus PPA, caractérisation moléculaire, homologie génétique, RDC, Afrique de l’ouest

Background: African swine fever (ASF) is a major threat to poverty alleviation and to food security especially for vulnerable rural populations in Africa. For these communauties, domestic pig is not only a cash provider for medical bills, school fees, and taxes, but also an affordable source of animal proteins. ASF is endemic in Sub-Saharan Africa, chiefly in the Democratic Republic of Congo (DRC).
Objective: Genotyping of circulating strains involved in the most severe outbreak in order to come up with phylogeographical link in terms of origin, for a better understanding of epidemiological pattern and then, for choice of a proper control strategy.
Material and methods: Blood and tissues samples collected on pigs from challenged locations; empiric assessment of apparent prevalence; ASF virus (ASFV) DNA detection, and genotyping using respectively indirect ELISA, PCR and Sequencing techniques  supported by confirmatory diagnostics such as cell cultures and immunehistochemistry.
Results : Anti – ASFV antibodies were detected in 73 animals out of 350 (20.8%), ASFV DNA was detected in specimens originating from 5 locations, genomic sequence was depicted from a severe outbreak isolate and different isolates sequences alignment allowed genetic relatedness establishment.
Conclusion: Genetic relationship was established between DRC and West Africa’isolates.
Key words: African swine fever virus, genotyping, genomic similarity, DRC, West Africa